Миссия КазАТК заключается в достижении предоставления высокого качества образовательных услуг в сфере высшего и послевузовского образования, лидерства в национальном образовательном пространстве по подготовке кадров для транспортно-коммуникационного сектора экономики Республики Казахстан посредством реализации принципов Болонского процесса и современных международных стандартов качества. Миссия отражает стремление академии на обеспечение высокого качества подготовки кадров через интеграцию образования, науки и производства, укрепление материально-технической базы и кадрового потенциала академии, применение современных методик и технологий в учебном процессе.

Видение КазАТК – признанное в Казахстане и за рубежом высшее учебное заведение по подготовке высокопрофессиональных специалистов для транспортно-коммуникационного комплекса, ведущий инновационный центр в области разработки нормативно-технической документации и внедрения новых техники и технологии в сфере транспорта и телекоммуникации.
Принятие миссии потребовало от коллектива академии определить приоритетные стратегические цели и задачи.

Стремление КазАТК соответствовать мировым тенденциям развития высшей школы и интегрироваться в мировое образовательное пространство обусловило стратегическую направленность целей и задач, связанных с развитием образовательной деятельности:

Главная задача – подготовка высококвалифицированных компетентных специалистов, способных адаптироваться к быстро изменяющимся социально-экономическим условиям.

Основным критерием качества подготовки специалистов должен стать высокий профессионализм, обеспечивающий конкурентноспособность выпускников и их востребованность на рынке труда.
Стратегическими задачами развития академии являются:
1) обеспечение повышения качества образовательных услуг;
2) прохождение процедуры независимой национальной и международной аккредитации;
3) участие и продвижение КазАТК в международных рейтингах;
4) обеспечение соответствия системы образования с научно-технической и инновационной политикой страны;
5) оказание образовательных услуг, обеспечивающих обучение на протяжении всей жизни.
Целью Стратегического плана развития КазАТК на 2011-2015 годы является определение комплекса мер, обеспечивающих повышение эффективности совместной работы профессорско-преподавательского состава и обучающихся КазАТК как действенного фактора позитивных изменений в содержании учебной, научной и воспитательной работы академии.

Стратегией развития определены три основных цели:
Цель 1. Качество высшего образования соответствует лучшим мировым практикам в области образования к 2020 году.
Задачи:
1) Функционирование высшей школы Казахстана в соответствии с основными параметрами Болонского процесса;
2) Повышение качества высшего и послевузовского образования
3) Подготовка кадров с высшим и послевузовским образованием для отраслей экономики, в том числе проектов индустриально-инновационного развития страны.
Цель 2. Научное и научно-техническое обеспечение форсированного индустриально-инновационного развития страны.
Задачи:
1) Повышение качества научных исследований и опытно-конструкторских разработок
2) Подготовка научных кадров и их стимулирование к исследовательской деятельности
Цель 3. Повышение патриотического самосознания и гражданской активности молодежи.